Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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CST6Q15828 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CST6Q15828 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CST6Q15828 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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CST6Q15828 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CST6Q15828 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CST6Q15828 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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