Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RYR3Q15413 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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