Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RAB35Q15286 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms