Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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