Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
APOFQ13790 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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APOFQ13790 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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