Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTCH1Q13635 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTCH1Q13635 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms