Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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