Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2Q13563 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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