Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKP2Q13309 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms