Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHAF1BQ13112 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms