Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXF1Q12946 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXF1Q12946 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXF1Q12946 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXF1Q12946 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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