Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPN13Q12923 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPN13Q12923 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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