Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms