Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBBP4Q09028 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms