Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms