Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE4BQ07343 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE4BQ07343 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms