Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms