Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNEQ04844 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms