Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7AQ04656 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP7AQ04656 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms