Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLOD1Q02809 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms