Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NHLH2Q02577 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms