Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SLC6A3Q01959 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms