Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MS4A2Q01362 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms