Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SPCS3P61009 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SPCS3P61009 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SPCS3P61009 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPCS3P61009 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPCS3P61009 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPCS3P61009 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPCS3P61009 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPCS3P61009 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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