Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ACTBP60709 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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ACTBP60709 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ACTBP60709 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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