Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms