Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AQP4P55087 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms