Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERFP50548 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ERFP50548 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERFP50548 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERFP50548 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERFP50548 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERFP50548 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERFP50548 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms