Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRT6CP48668 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms