Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPD2P43304 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GPD2P43304 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPD2P43304 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPD2P43304 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPD2P43304 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPD2P43304 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms