Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CASP2P42575 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms