Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HPCAL1P37235 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPCAL1P37235 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms