Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF2P35227 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF2P35227 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms