Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNB1P35222 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms