Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TSPOP30536 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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