Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SSFA2P28290 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSFA2P28290 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms