Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms