Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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