Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CNTFRP26992 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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