Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms