Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPH2P23942 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms