Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BCKDHBP21953 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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