Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL2P19875 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms