Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME1P15531 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME1P15531 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME1P15531 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms