Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT10P13645 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms