Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms