Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms