Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEFHP12036 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEFHP12036 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NEFHP12036 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEFHP12036 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEFHP12036 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEFHP12036 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEFHP12036 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEFHP12036 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEFHP12036 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms