Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGAMP11215 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms