Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAMC1P11047 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms